macOS/Linux版(Raspberry Piを含む)は、基本的にコマンドライン版の提供となっています。コマンドライン版を利用するには、ターミナル(Terminal)を利用します。
解凍したら、サクラを解凍したディレクトリにカレントディレクトリを移動します。cd コマンドを使います。(以下の行頭の「$」は入力する必要ありません)
$ cd 解凍したディレクトリ
csakuraコマンドを使って、サクラのMMLファイルをMIDIファイルに変換します。例えば、test.mmlというファイルであれば次のように記述します。
$ ./csakura test.mml
すると、test.midというファイルが作成されます。
※MMLファイルは、文字コードShift_JISで記述してください。