通りがかりです。初歩的なケースではすぐに治ると思いますが、難しい場合だと修正は時間がかかるかもしれません。
自分の場合でも良くあるのですが、トラックボリューム[V]、エクスプレッション[EP]などの値が[0]になっているケースです。もし和音が鳴るはずの部分で、演奏モニターのピアノロールの横にあるボリュームレベル表示が動いていなければ、トラックボリューム[ V(0) ]、エクスプレッション[ EP(0) ]の可能性があります。
確認法としては、演奏モニターのボリュームレベルの部分をクリックすると、表示が変わって小さな表示のレベルメーターに変わります。その中の灰色と濃い灰色のレベルメーターの針がこの演奏部分で何も触れてなければまず、間違いなくどちらかのために音が出なくなっています。この場合、V(127)ないしは、EP(127)を和音の前に差し込んであげれば多分直ると思います。
難しい場合では、ゲートタイム[q]の値が[100]以上で和音が鳴らされている、ないしはペダルが使われている場合が考えられます。もし、このケースであれば、直すのはあまり簡単ではありません。
もしゲートタイムであれば、この和音の前あたりに[q99]以下を指定すれば全ての音が鳴るかもしれません。
ペダルでは、あまり使ったことがないので何とも言えないのですが、その近辺だけ解除して鳴らしてみるのも一手かも知れません。この場合、その場その場で対応することが多いので近辺のソースを見てみないと解りません。
また、ボイス数制限を超えてしまった場合もあります。
サクラでは多分同時にならせるのが32ボイス? が限界なので、超えてしまうと特定のパートの音が出なくなります。
あまりないケースだと思いますが、他のトラックをコメントアウトなどしてミュートすると音がでる場合は当てはまると思います。