＞１ ギターはどのようなメロディーでつければよいのでしょうか？
どのようなメロディでもかまいませんが、基本的なメロディ、
特に強拍に使われる音程は、その曲のキーである、ダイアトニック
スケールか、コードごとのアヴェイラブル・ノート・スケールが
使われます。
＞２ これらは全部同じコード進行にしなければいけないのでしょうか？
これも決まりはありません。物語のストーリーの進行と同じで自由です。
＞３ １でコード進行を行ったピアノは各パートの編曲をするときにそのままでいいのでしょうか？
ピアノのコード進行をガイドとして仮に入れたものの場合、ほとんどは
アレンジの際に他のアンサンブルと調整します。
ピアノのコード進行そのものがメインの場合は、そのコードに合うように
他のアンサンブルを調整します。（印象の強いバッキングなど）
通常、アレンジは「どのような方向性にするのか」を明確にしますので
コードを変える場合、先に方向性が必要になると思います。